Funkcja zagnieżdżania umożliwia grupowy wydruk wielu zadań jako pojedynczego zadania. Oprogramowanie Command WorkStation rozmieszcza zagnieżdżane strony w sposób oszczędzający przestrzeń, co pozwala ograniczyć ilość strat z nośników.

W celu utworzenia zagnieżdżenia zaimportuj i zaznacz wiele zadań w Centrum zadań. Ustawienia zadań konfiguruje się w oknie Właściwości zadania. Można to zrobić indywidualnie dla każdego zadania podrzędnego (zadania uwzględnione w zagnieżdżeniu) albo dla zadania nadrzędnego (zagnieżdżenie). Nie wszystkie opcje zadań są dostępne. Opcje zagnieżdżania (układu) konfiguruje się w aplikacji Template Manager, wykorzystując zadania zastępcze. Również w programie Template Manager skonfigurowane ustawienia można zapisać jako szablon, a następnie, na przykład, zastosować go do poszczególnych zadań.